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Genome Res ; 29(8): 1343-1351, 2019 08.
Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-31186303

RESUMO

Eukaryotic gene expression is often tightly regulated by interactions between transcription factors (TFs) and their DNA cis targets. Yeast one-hybrid (Y1H) is one of the most extensively used methods to discover these interactions. We developed a high-throughput meiosis-directed yeast one-hybrid system using the Magic Markers of the synthetic genetic array analysis. The system has a transcription factor-DNA interaction discovery rate twice as high as the conventional diploid-mating approach and a processing time nearly one-tenth of the haploid-transformation method. The system also offers the highest accuracy in identifying TF-DNA interactions that can be authenticated in vivo by chromatin immunoprecipitation. With these unique features, this meiosis-directed Y1H system is particularly suited for constructing novel and comprehensive genome-scale gene regulatory networks for various organisms.


Assuntos
DNA/genética , Análise em Microsséries/métodos , Saccharomyces cerevisiae/genética , Fatores de Transcrição/genética , Técnicas do Sistema de Duplo-Híbrido , Animais , DNA/metabolismo , Regulação da Expressão Gênica , Redes Reguladoras de Genes , Marcadores Genéticos , Humanos , Meiose , Análise em Microsséries/instrumentação , Plasmídeos/química , Plasmídeos/metabolismo , Ploidias , Populus/citologia , Ligação Proteica , Protoplastos/citologia , Protoplastos/metabolismo , Saccharomyces cerevisiae/metabolismo , Fatores de Tempo , Fatores de Transcrição/metabolismo
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